Shimizu Lab. Graduate School of Information Science and Technology,Osaka University

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Books

2018

  1. 代謝センシング-健康、食、美容、そして脳の代謝を知る-, 第25章培養動物細胞の13C代謝フラックス解析, シーエムシー出版, 監修 三林浩二, 岡橋伸幸, 松田史生, 清水浩, p.218-228 (2018年9月)

2017

  1. Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, and Fumio Matsuda,: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes,BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5,Toshiomi Yoshida(eds),Wiley-VCH, pp. 201-236(2017. Feb)
  2. Kazuyuki Shimizu, Hiroshi Shimizu, Toshiomi Yoshida,BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 8, Control of Microbial Processes,BIOTECHNOLOGY, Toshiomi Yoshida(eds), pp.237-258 (2017. Feb)

2016

  1. Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu,BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 4: Indsutrial Biotechnology Products and Processes, Chapter 11. Glutamic acid fermentation: Discovery of glutamic acid-producing microorganisms, analysis of the production mechanism, metabolic engineering and industrial production process,BIOTECHNOLOGY, Christoph Wittmann and James Liao(eds), pp. 339-360(2016. Nov)

2014

  1. Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu, Chapter 17 Glutamic Acid, In:Bioprocessing of Renewable Resources to Commodity Bioproducts, Akihiko Kondo and Virendra Bisaria (eds), Weiley, p. 473-495 (2014. Apr)

2012

  1. 生命システム工学, 第8章 システムズ代謝工学および細胞表層工学による微生物工場開発, 松田史生, 近藤昭彦, 化学同人, p.147-176(2012年12月)
  2. 日本生物工学会編, バイオにもコンピュータが役立つってホント?ひらく、ひらく「バイオの世界」、14歳からの生物工学入門, 清水浩, 化学同人, p.84-85(2012年10月)
  3. Takashi Hirasawa, Jongpill Kim, Tomokazu Shirai, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Molecular mechanisms and metabolic engineering of glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum, In: Subcellular Biochemistry Vol. 64, Reprogramming Microbial Metabolic Pathways, Xiaoyuan Wang, Jian Chen and Peter J. Quinn (eds.), Springer, p.261-281(2012. Oct)
  4. Katsunori Yoshikawa, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu, Design of Superior Cell Factories Based on Systems Wide Omics Analysis, In: Systems Metabolic Engineering Chapter3, Christoph Wittmann, Sang Yup (eds.), Springer, p.57-82(2012. Sep)
  5. Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu , Systems metabolic engineering: the creation of microbial cell factories by rational metabolic design and evolution, In: Advanced Biochemical, Engineering/Biotechnology, Jian-Jiang Zhong (ed), Springer, p.1-23(2012. Jun)
  6. 合成生物工学の隆起 ―有用物質の新たな生産法構築をめざして― 第3章 オミクス解析の視点 第2節 ゲノムスケール代謝デザインとフラックス解析による微生物細胞創製,清水浩, 古澤力, 白井智量, 吉川勝徳, 平沢敬, シーエムシー出版, p.57-66(2012年4月)
  7. 遺伝子工学, 第12章 ゲノム・生物情報工学, 近藤昭彦, 芝崎誠司(編者), 清水浩, 化学同人, p.170-181(2012年3月)

2011

  1. 高等研報告書1005 生物進化の持続性と転移(研究代表者 津田一郎), 第2章 大腸菌の長期植え継ぎ培養における表現型・遺伝子型の網羅的解析, 古澤力, 堀之内貴明, 清水浩, 財団法人国際高等研究所, p.19-29(2011)

2008

  1. Naoaki Ono, Duraid Madina, Takashi Ikegami, Origin of Life and Lattice Artificial Chemistry, In: Protocells~Bridging Nonliving and Living Matter, S. Rasmussen et al. (eds.), MIT Press, p.197-212(2008. Nov)
  2. ベーシックマスター生化学, 第9章クエン酸回路と電子伝達系, 大山隆(監修), 西川一八・清水光弘(共著), 平沢敬, オーム社, p.188-206(2008年11月)
  3. ネットワーク科学への招待, 複製細胞の反応ネットワークダイナミクス, 青山秀明・相馬亘・藤原義久(共編著), 金子邦彦, 古澤力, サイエンス社, p. 76-83 (2008年7月)
  4. メタボロミクスの先端技術と応用, 第14章メタボロームデータを用いた代謝フラックス解析, 福崎英一郎(監修), 清水浩, 古澤力, 白井智量, シーエムシー出版, p.171-184 (2008年1月)

2007

  1. ネットワーク科学の道具箱~つながりに隠れた現象をひもとく~, 第5章コミュニティ抽出法~社会ネットワーク分析から大規模解析まで~, 林幸(編著), 小野直亮, 湯田聴夫, 近代科学社, p.119-156(2007年11月)

2006

  1. バイオインフォマティクス事典, (バイオインフォマティクス学会編), 代謝フラックス解析p.709-711, 代謝制御解析p.716-717, 清水浩, 共立出版(2006年6月)
  2. バイオプロダクション、化学工学会バイオ部会編、4章メタボリックエンジニアリング、pp. 57-62、コロナ社 (2006年4月)

2005

  1. 生物工学ハンドブック, 日本生物工学会編, 7章培養工学, 7.5.3代謝工学的手法と培養操作の実際, 清水浩, pp.444-449 (2005年6月)
  2. Hiroshi Shimizu, Suchada Chanprateep, Songsri Kulpreecha, Atipol Boonruangthavorn, Suteaki Shioya, Development of Production Processes of A Biodegradable Polymer, Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate)-Metabolic Pathway Analysis, Quality Control of Polymer, and Use of Starch, Biotechnology for sustainable utilization of biological resources in the tropics (ed. T. Seki), 17, 78-83 (2005. Mar)
  3. Weeramuch Madilhoo, Kamidha Jariya Chavalit, Sompop Moonchai, Hiroshi Shimizu, Suteaki Shioya, Somchai Chauvatcharin, Process optimization for bacteriocin production in L. lactis C7: Effects pf cultured pH and temperature on bacteriocin production, Biotechnology for sustainable utilization of biological resources in the tropics( ed. T. Seki), 17, 32-37 (2005. Mar)

2004

  1. Hiroshi Shimizu, Takashi Hirasawa, Keisuke Nagahisa, Suteaki Shioya, Analysis of responses of complex bionetworks to changes in environmental conditions, Lecture Note Series of Computer Science, Vol. 3141, Biologically Inspired Approaches to Advanced Information Technology, First International Workshop, BioADIT 2004, Lausanne, Switzerland, January 29-30, 2004, Revised Selected Papers (Auke Jan Ijspeert, Masayuki Murata and Naoki Wakamiya (ed)), p. 13-27, Springer (2004. Oct)
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